Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP6AP1Q15904 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms