Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VAMP3Q15836 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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VAMP3Q15836 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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