Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNB3Q15768 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms