Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMGN3Q15651 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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