Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1CQ15572 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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