Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CYTH1Q15438 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYTH1Q15438 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms