Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDGFRLQ15198 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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