Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLD3Q15054 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLD3Q15054 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms