Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHPRHQ149N8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms