Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms