Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RFTN1Q14699 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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