Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SEMA3AQ14563 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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