Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF1Q14162 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF1Q14162 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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