Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGRF1Q13972 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms