Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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