Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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ITGA9Q13797 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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ITGA9Q13797 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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ITGA9Q13797 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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