Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRPF4BQ13523 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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