Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PICALMQ13492 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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