Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMAD4Q13485 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMAD4Q13485 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
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