Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XRCC4Q13426 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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