Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P3Q13401 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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