Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPA4Q13156 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPA4Q13156 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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