Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP3Q12983 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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