Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NCBP1Q09161 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NCBP1Q09161 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms