Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMSAP2Q08AD1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMSAP2Q08AD1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms