Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms