Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GABPAQ06546 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms