Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALD1Q05682 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms