Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPEQ02224 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms