Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC6A3Q01959 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms