Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT76Q01546 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms