Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MS4A2Q01362 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms