Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1BQ00975 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1BQ00975 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms