Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms