Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM3AP98173 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms