Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRB1P82279 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRB1P82279 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRB1P82279 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRB1P82279 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRB1P82279 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CRB1P82279 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRB1P82279 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRB1P82279 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CRB1P82279 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRB1P82279 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CRB1P82279 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRB1P82279 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRB1P82279 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRB1P82279 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRB1P82279 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRB1P82279 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRB1P82279 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB1P82279 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB1P82279 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB1P82279 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB1P82279 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB1P82279 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB1P82279 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRB1P82279 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms