Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTG1P63261 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms