Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPNP63162 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms