Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms