Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB1P62873 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB1P62873 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB1P62873 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB1P62873 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB1P62873 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB1P62873 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB1P62873 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB1P62873 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB1P62873 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms