Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS29P62273 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS29P62273 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS29P62273 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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