Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP25P60880 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms