Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTBP60709 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTBP60709 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms