Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF3P57682 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF3P57682 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF3P57682 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF3P57682 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF3P57682 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF3P57682 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF3P57682 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLF3P57682 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms