Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIPPLY3P57055 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms