Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BACE1P56817 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BACE1P56817 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BACE1P56817 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BACE1P56817 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BACE1P56817 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BACE1P56817 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BACE1P56817 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BACE1P56817 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BACE1P56817 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BACE1P56817 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms