Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP2P56545 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms