Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP9P55211 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CASP9P55211 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASP9P55211 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASP9P55211 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASP9P55211 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CASP9P55211 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASP9P55211 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms