Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AFDNP55196 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AFDNP55196 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AFDNP55196 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AFDNP55196 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AFDNP55196 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AFDNP55196 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AFDNP55196 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AFDNP55196 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AFDNP55196 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AFDNP55196 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AFDNP55196 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFDNP55196 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFDNP55196 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms