Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-5P52952 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms